En la oración "Quien a buen árbol se arrima, buena sombra le cobija", tenemos una oración principal: "buena sombra le cobija" y una subordinada adjetiva sustantivada. "Quien a buen árbol se arrima".

En la oración principal, "buena sombra " haría de SUJETO  y el "le", que es un caso de leísmo, de CD ("lo cobija").

La O. S. Adj. Sust. haría de CD porque el refrán ha eliminado la preposición "A" propia de los CD de persona y que tendría que introducirla( "A quien a buen árbol se arrima, buena sombra le cobija"), seguramente para evitar el exceso de "Aes".

En resumen, la OP tendría dos CD, uno pronominal "le"= "lo" y el otro la Oración Subordinada.